В десяти верстах от Можайска на дороге в Верею и Боровск, на высоком берегу реки Протвы в 1600 г. в присутствии Бориса Годунова был основан Царь-Борисов городок, построена каменная крепость с четырьмя башнями, выкопаны пруд и рвы. В 1618 г. крепость выдержала два приступа войск польского королевича Владислава. Село Борисово было вотчиной Бориса Годунова еще до его воцарения, здесь в 1585-1586 гг. им была воздвигнута каменная шатровая церковь святых страстотерпцев Бориса и Глеба высотой 74 метра. В 1603 г. царь Борис Феодорович с царицею и детьми ходил на богомолье в Пафнутьев-Боровский монастырь, оттуда приехал в Царь-Борисов городок и присутствовал при освящении церкви.
После Смутного времени вся Можайская земля лежала в запустении. Писцовая книга уезда за 1629 г. сообщает: “Село Борисово на реке Протве, что было село государево дворцовое, а в нем храм каменный вверх (то есть шатровый) во имя страстотерпцев Бориса и Глеба, да в селе Борисове место церковное, что был храм во имя Иоанна Предтечи, а в нем образы и книги и все церковное строение было мирское, храм сожгли литовские люди. Да в селе Борисове место монастырское, что был монастырь Рождества Божией Матери, а в церкви образы и книги и все церковное строение было прежних государей жалованье, да в том же монастыре было 15 келий”.
Церковь Бориса и Глеба и остатки каменной крепости были разобраны в начале XIX в.
Впервые в документах деревянная церковь в честь Обновления храма Воскресения Христова в Борисове упоминается в 1653 г., “у той церкви два двора поповых, в приходе 131 двор”. В 1738 г. при церкви служили два священника – Гаврила Иванов и Иван Иванов.
В 1811 г. построена ныне существующая каменная церковь с престолами в честь Обновления храма Воскресения Христова, Собора Божией Матери, святых страстотерпцев Бориса и Глеба. К ней была приписана деревянная церковь Святителя Николая в селе Старом.
Настоятель храма преподавал Закон Божий в Борисовском начальном училище. В 1890-х годах настоятелем был священник Алексий Викторович Строганов.
В советское время храм в Борисове закрыт, лишился завершающей церковное здание ротонды и колокольни и был перестроен под клуб.
До настоящего времени церковь находится в стадии передачи приходу. В конце 2001 г. под богослужение отдано старое кирпичное здание, которое находится рядом с храмом. В нем начали совершать богослужения, сделали крестообразную купель для крещения. Постройка ремонтируется, и у прихожан есть намерение устроить впоследствии здесь домовую церковь в честь святых Царственных мучеников.
Летом забил источник между двумя холмами, на которых стояли Борисоглебская церковь и неприступная годуновская крепость. Над источником построили часовню.