В начале XVIII в. село Филатово числилось как Рождественский погост на реке Мологоще. Здесь в 1704 г. Косьмой Думашевым была построена деревянная церковь. В начале 1750-х гг. помещицей А.Д. Вороновой (урожд. Думашевой) и ее сыновьями Алексеем и Михаилом была выстроена домовая каменная церковь в честь Рождества Христова, которая существует и до ныне. Антиминс на освящение церкви выдан в 1778 г.
В 1808 г. (или 1810) деревянная церковь на Рождественском погосте сгорела. Усадьба Филатово в этом время принадлежала прапорщику П.А. Ханенееву, которому было предписано перенести уцелевшие вещи из сгоревшей деревянной церкви в его домовую каменную, в связи с утверждением ее в качестве приходской церкви (1818 г.). Для передачи приходу «весной будущего 1819 года» П.А. Ханенеев обязался «обстроить» свою «ветхую» домовую церковь: привести в порядок кровлю и крыльца. Обустройство вылилось в реконструкцию храма в новых стилевых формах классицизма. В 1842 г. в церкви был сделан новый трехъярусный иконостас. В 1880 г. при новом владельце усадьбы, поручике С.И. Соколове, были украшены все стены внутри храма живописью, а несколько лет спустя был сделан наружный ремонт, во время которого стены церкви оштукатурили.
В начале XIX в. к церкви была пристроена колокольня, которая завершила наружное убранство в целом в стиле классицизма.
После революции храм был закрыт. В послевоенные годы сломаны колокольня, трапезная, апсида и глава на храме, разрушена часть оконных проемов.
С 2010 г. церковь в активной стадии реставрации.
В 1808 г. (или 1810) деревянная церковь на Рождественском погосте сгорела. Усадьба Филатово в этом время принадлежала прапорщику П.А. Ханенееву, которому было предписано перенести уцелевшие вещи из сгоревшей деревянной церкви в его домовую каменную, в связи с утверждением ее в качестве приходской церкви (1818 г.). Для передачи приходу «весной будущего 1819 года» П.А. Ханенеев обязался «обстроить» свою «ветхую» домовую церковь: привести в порядок кровлю и крыльца. Обустройство вылилось в реконструкцию храма в новых стилевых формах классицизма. В 1842 г. в церкви был сделан новый трехъярусный иконостас. В 1880 г. при новом владельце усадьбы, поручике С.И. Соколове, были украшены все стены внутри храма живописью, а несколько лет спустя был сделан наружный ремонт, во время которого стены церкви оштукатурили.
В начале XIX в. к церкви была пристроена колокольня, которая завершила наружное убранство в целом в стиле классицизма.
После революции храм был закрыт. В послевоенные годы сломаны колокольня, трапезная, апсида и глава на храме, разрушена часть оконных проемов.
С 2010 г. церковь в активной стадии реставрации.