Село Пречистое известно с конца XVI в. Тогда это было с. Поповское, состоявшее в Ижевском стане Дмитровского уезда. В селе была церковь Успения Пресвятой Богородицы. В Смутное время село запустело. В начале XVII в. упоминается «пустошь, что было село Поповское, а в ней место церковное, где была церковь Успения Пречистыя Богородицы»
В 1635 г. пустошь Поповская была продана из Поместного приказа Константину Сытину в вотчину. В этом году здесь была построена новая Успенская церковь, причисленная к Дмитровской десятине Патриаршего казенного приказа. В 1684 г. церковь перечислена в Волоколамскую десятину. Село Поповское было названо Пречистенским, Поповским тож.
В 1813 г., после изгнания Наполеона из России, благочинный докладывал своему начальству, что церковь Успения в с. Пречистенском, «однопрестольная, деревянного здания, не видав, по благости Божией, никакого неприятельского нахождения состояла в целости». По ведомости от 5 ноября 1813 г., церковь была «в твердости», при ней был 141 приходский двор, в том числе 93 двора экономического ведомства и 48 разных (всего 484 мужчины и 542 женщины).
Новая каменная церковь Успения Божией Матери, на этот раз с приделом Святителя Николая, была построена в 1858 г. В 1866 г. в ее приходе было 83 двора, 296 прихожан, 357 прихожанок.
В 1906 г. в селе числилась начальная земская школа, основанная в 1899г. (1 учитель, 38 учеников).
Во времена советской власти решением исполкома мособлсовета в августе 1940г. храм решено переоборудовать под школу. Во время Великой Отечественной войны здание церкви было взорвано.
В 2011 году благотворителем Успенского храма деревни Пречистое был изготовлен и 1 апреля установлен храмовый купол.